Dyrektor generalny Urzędu kieruje Pracą Urzędu.

W szczególności:

  1. tworzy warunki działania i organizacji pracy w Urzędzie,
  2. realizuje politykę personalną w służbie cywilnej,
  3. wykonuje zadania służby cywilnej w Urzędzie,
  4. dokonuje czynności w zakresie prawa pracy wobec pracowników Urzędu,
  5. reprezentuje Skarb Państwa w zakresie powierzonego mienia i działania Urzędu.

Dyrektor Generalny Urzędu podlega bezpośrednio wojewodzie. Nadzoruje pracę Biura Organizacji, Kadr i Informatyki, Wydziału Certyfikacji i Funduszy Europejskich oraz Zespołu Audytu Wewnętrznego.

Dyrektor Generalny Urzędu zapewniając sprawne funkcjonowanie Urzędu, warunki jego działania, a także organizację pracy, wydaje w tym zakresie zarządzenia oraz stosowne polecenia dyrektorom wydziałów Urzędu.